Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms