Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc183A2AJB1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms