Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl2A2AGA4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhbdl2A2AGA4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhbdl2A2AGA4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhbdl2A2AGA4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhbdl2A2AGA4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhbdl2A2AGA4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl2A2AGA4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl2A2AGA4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl2A2AGA4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl2A2AGA4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl2A2AGA4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl2A2AGA4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl2A2AGA4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl2A2AGA4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl2A2AGA4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl2A2AGA4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl2A2AGA4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl2A2AGA4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms