Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
Prdm2A2A7B5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prdm2A2A7B5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms