Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fbxo47A2A6H3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxo47A2A6H3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms