Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul4bA2A432 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms