Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm6268A2A3U9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm6268A2A3U9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm6268A2A3U9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm6268A2A3U9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm6268A2A3U9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm6268A2A3U9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm6268A2A3U9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm6268A2A3U9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm6268A2A3U9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm6268A2A3U9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm6268A2A3U9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm6268A2A3U9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm6268A2A3U9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm6268A2A3U9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm6268A2A3U9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm6268A2A3U9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm6268A2A3U9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm6268A2A3U9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm6268A2A3U9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm6268A2A3U9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms