Protein–RNA interactions for Protein: A1L0T3

Ssc4d, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc4dA1L0T3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssc4dA1L0T3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms