Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc173A0JLY1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms