Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms