Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4921501E09RikA0A0R4J054 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms