Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Trbv26A0A0B4J1P5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Trbv26A0A0B4J1P5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Trbv26A0A0B4J1P5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Trbv26A0A0B4J1P5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Trbv26A0A0B4J1P5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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