Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trbv30A0A0B4J1P1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Trbv30A0A0B4J1P1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trbv30A0A0B4J1P1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trbv30A0A0B4J1P1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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