Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms