Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G7

Trbv1, T cell receptor beta, variable 1 (Fragment), mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trbv1A0A0B4J1G7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trbv1A0A0B4J1G7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trbv1A0A0B4J1G7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trbv1A0A0B4J1G7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trbv1A0A0B4J1G7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trbv1A0A0B4J1G7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trbv1A0A0B4J1G7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trbv1A0A0B4J1G7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trbv1A0A0B4J1G7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trbv1A0A0B4J1G7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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