Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYE3

Trbv15, T cell receptor beta, variable 15 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv15A0A0A6YYE3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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