Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv21A0A0A6YX06 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms