Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQI7

B020011L13Rik, RIKEN cDNA B020011L13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020011L13RikA0A087WQI7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
B020011L13RikA0A087WQI7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms