Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Q0

Ighv5-6, Immunoglobulin heavy variable 5-6 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-6A0A075B5Q0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ighv5-6A0A075B5Q0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-6A0A075B5Q0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-6A0A075B5Q0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ighv5-6A0A075B5Q0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-6A0A075B5Q0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-6A0A075B5Q0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-6A0A075B5Q0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-6A0A075B5Q0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ighv5-6A0A075B5Q0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ighv5-6A0A075B5Q0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ighv5-6A0A075B5Q0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ighv5-6A0A075B5Q0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ighv5-6A0A075B5Q0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ighv5-6A0A075B5Q0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Ighv5-6A0A075B5Q0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-6A0A075B5Q0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-6A0A075B5Q0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Ighv5-6A0A075B5Q0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-6A0A075B5Q0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-6A0A075B5Q0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-6A0A075B5Q0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-6A0A075B5Q0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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