Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ST13P6-201ENST00000522430 1102 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ESRP1-201ENST00000358397 3756 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ADAMTS9-AS2-202ENST00000474768 2388 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 PRLR-219ENST00000619676 1402 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 JAML-206ENST00000526620 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 CEACAM5-203ENST00000405816 2354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 VWC2L-IT1-201ENST00000416430 467 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 GEMIN2P2-201ENST00000418195 715 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL022100.1-202ENST00000421214 548 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ANKRD54P1-201ENST00000433115 471 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC063962.1-201ENST00000608199 521 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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