Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrit3W8DXL4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrit3W8DXL4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrit3W8DXL4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrit3W8DXL4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrit3W8DXL4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit3W8DXL4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit3W8DXL4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit3W8DXL4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit3W8DXL4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit3W8DXL4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit3W8DXL4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit3W8DXL4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit3W8DXL4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit3W8DXL4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit3W8DXL4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit3W8DXL4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit3W8DXL4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit3W8DXL4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit3W8DXL4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit3W8DXL4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit3W8DXL4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit3W8DXL4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit3W8DXL4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit3W8DXL4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit3W8DXL4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms