Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms