Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt6bQ9Z331 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt6bQ9Z331 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt6bQ9Z331 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt6bQ9Z331 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt6bQ9Z331 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt6bQ9Z331 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms