Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms