Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J0

Slc23a1, Solute carrier family 23 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc23a1Q9Z2J0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc23a1Q9Z2J0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc23a1Q9Z2J0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms