Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upk1bQ9Z2C6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms