Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tulp1Q9Z273 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tulp1Q9Z273 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tulp1Q9Z273 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tulp1Q9Z273 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tulp1Q9Z273 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tulp1Q9Z273 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tulp1Q9Z273 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tulp1Q9Z273 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tulp1Q9Z273 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tulp1Q9Z273 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tulp1Q9Z273 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tulp1Q9Z273 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tulp1Q9Z273 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tulp1Q9Z273 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tulp1Q9Z273 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tulp1Q9Z273 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tulp1Q9Z273 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tulp1Q9Z273 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tulp1Q9Z273 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tulp1Q9Z273 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tulp1Q9Z273 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tulp1Q9Z273 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tulp1Q9Z273 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms