Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms