Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccne2Q9Z238 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccne2Q9Z238 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccne2Q9Z238 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccne2Q9Z238 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccne2Q9Z238 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccne2Q9Z238 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccne2Q9Z238 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccne2Q9Z238 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccne2Q9Z238 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccne2Q9Z238 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccne2Q9Z238 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccne2Q9Z238 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccne2Q9Z238 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms