Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1S3

Rasgrp1, RAS guanyl-releasing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgrp1Q9Z1S3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgrp1Q9Z1S3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rasgrp1Q9Z1S3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rasgrp1Q9Z1S3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rasgrp1Q9Z1S3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rasgrp1Q9Z1S3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rasgrp1Q9Z1S3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgrp1Q9Z1S3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgrp1Q9Z1S3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgrp1Q9Z1S3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgrp1Q9Z1S3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgrp1Q9Z1S3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgrp1Q9Z1S3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgrp1Q9Z1S3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgrp1Q9Z1S3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgrp1Q9Z1S3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgrp1Q9Z1S3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgrp1Q9Z1S3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgrp1Q9Z1S3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgrp1Q9Z1S3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgrp1Q9Z1S3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgrp1Q9Z1S3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgrp1Q9Z1S3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgrp1Q9Z1S3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgrp1Q9Z1S3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgrp1Q9Z1S3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasgrp1Q9Z1S3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms