Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms