Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms