Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms