Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E2

Chrd, Chordin, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrdQ9Z0E2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChrdQ9Z0E2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChrdQ9Z0E2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms