Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clcn5Q9WVD4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clcn5Q9WVD4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clcn5Q9WVD4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clcn5Q9WVD4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clcn5Q9WVD4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clcn5Q9WVD4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clcn5Q9WVD4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clcn5Q9WVD4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms