Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tnfsf13bQ9WU72 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms