Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scnn1bQ9WU38 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms