Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR0

Mmp16, Matrix metalloproteinase-16, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp16Q9WTR0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Mmp16Q9WTR0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mmp16Q9WTR0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp16Q9WTR0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp16Q9WTR0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp16Q9WTR0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp16Q9WTR0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp16Q9WTR0 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp16Q9WTR0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp16Q9WTR0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp16Q9WTR0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp16Q9WTR0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp16Q9WTR0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp16Q9WTR0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp16Q9WTR0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp16Q9WTR0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp16Q9WTR0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp16Q9WTR0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp16Q9WTR0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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