Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PplQ9R269 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PplQ9R269 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PplQ9R269 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PplQ9R269 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PplQ9R269 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PplQ9R269 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PplQ9R269 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PplQ9R269 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PplQ9R269 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PplQ9R269 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PplQ9R269 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms