Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms