Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms