Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps29Q9QZ88 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms