Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf1Q9QZ09 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms