Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms