Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nufip1Q9QXX8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms