Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip4Q9QXN3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trip4Q9QXN3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms