Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpsf3Q9QXK7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpsf3Q9QXK7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpsf3Q9QXK7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf3Q9QXK7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf3Q9QXK7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf3Q9QXK7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf3Q9QXK7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf3Q9QXK7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf3Q9QXK7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf3Q9QXK7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf3Q9QXK7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf3Q9QXK7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf3Q9QXK7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf3Q9QXK7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf3Q9QXK7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf3Q9QXK7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf3Q9QXK7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf3Q9QXK7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf3Q9QXK7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf3Q9QXK7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf3Q9QXK7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf3Q9QXK7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpsf3Q9QXK7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cpsf3Q9QXK7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpsf3Q9QXK7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms