Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms