Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM4

Slamf1, Signaling lymphocytic activation molecule, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slamf1Q9QUM4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slamf1Q9QUM4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slamf1Q9QUM4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slamf1Q9QUM4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slamf1Q9QUM4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slamf1Q9QUM4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slamf1Q9QUM4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slamf1Q9QUM4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slamf1Q9QUM4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slamf1Q9QUM4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slamf1Q9QUM4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slamf1Q9QUM4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slamf1Q9QUM4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slamf1Q9QUM4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slamf1Q9QUM4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slamf1Q9QUM4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slamf1Q9QUM4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slamf1Q9QUM4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slamf1Q9QUM4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slamf1Q9QUM4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slamf1Q9QUM4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slamf1Q9QUM4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slamf1Q9QUM4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slamf1Q9QUM4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slamf1Q9QUM4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slamf1Q9QUM4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slamf1Q9QUM4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slamf1Q9QUM4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slamf1Q9QUM4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slamf1Q9QUM4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slamf1Q9QUM4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms