Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms